Validasi Invalid adalah pemeriksaan data yang menandai kolom atau indikator yang belum diisi secara lengkap atau tidak memenuhi ketentuan. Pada Aplikasi Dapodik, data yang gagal validasi ini akan ditandai dengan ikon merah. Berbeda dengan validasi warning, validasi invalid bersifat blokir—artinya, selama masih ada data invalid, satuan pendidikan tidak dapat melakukan proses sinkronisasi atau pengiriman data ke server. Oleh karena itu, semua peringatan invalid harus diperbaiki terlebih dahulu dengan melengkapi atau membenahi data sesuai ketentuan sebelum melanjutkan sinkronisasi.